Лицензия JIRA Agile привязана к редакции JIRA, то есть на какое количество пользователей у Вас лицензия JIRA, на такое же количество пользователей нужен и JIRA Agile.
То же самое касается некоторых других плагинов, таких как Team Calendars, Gliffy, AdHoc, Tempo и др. Количество пользователей в редакции плагина должно быть таким же, как и в самом продукте – JIRA, Confluence и т.д. О необходимом количестве лицензий конкретного плагина можно прочитать в его описании.